Meski Honda Scoopy PGM-FI memiliki struktur mesin yang sama dengan Honda Beat-FI, namun ada aspek yang berbeda. Basic mesin sama dengan mesin Beat-FI tapi perbedaannya ada di timing pengapian.
Perbedaan selanjutnya jelas akan terlihat dengan akselerasi yang diberikan oleh keduanya. Akselerasinya juga akan berbeda, karena masih banyak faktor yang mempengaruhinya. Seperti sasis yang berbeda, cover yang lebih berat, dan lain-lain.
Untuk nafas BeAT FI akan lebih panjang dibandingkan dengan nafas Scoopy-FI. Untuk langsamnya atau stasioner putaran busi menerima percikan api, kedua varian ini berada di 7 derajat di 1.700 rpm.
Untuk Scoopy-PGM FI, titik pengapian Advance 65 derajat akan berada di 6.500 rpm. Sedangkan BeAT berada di RPM yang lebih tinggi yakni 7.000 rpm.
Ini yang membuat BeAT memiliki nafas yang lebih panjang. Selain itu berat juga menentukan, untuk Honda Scoopy FI memiliki berat hingga 96 kg, sedangkan Honda BeAT FI memiliki berat 94 kg, ini yang membuat BeAT FI lebih kenceng sedikit (lebih memiliki nafas yang lebih panjang).
